Η Πανεπιστημιακή Αιματολογική Κλινική ιδρύθηκε το 1998 (ΦΕΚ 193 19/8/1998), εγκαταστάθηκε το 2004 (ΦΕΚ B 1066 01/08/2003) και αποτελεί τριτοβάθμιο κέντρο διάγνωσης και θεραπείας αιματολογικών νοσημάτων που καλύπτει το σύνολο της ΒΔ Ελλάδας και γειτονικών περιοχών και νήσων. Προσφέρει επίσης προπτυχιακή εκπαίδευση και άσκηση σε φοιτητές του  Ιατρικού Τμήματος της Σχολής Επιστημών Υγείας του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων, τετραετή εκπαίδευση για την Ειδικότητα της Αιματολογίας και παράγει σημαντικό ακαδημαϊκό ερευνητικό έργο.

Στην Αιματολογική Κλινική αντιμετωπίζονται ασθενείς με αιματολογικές νεοπλασματικές νόσους (οξείες και χρόνιες λευχαιμίες, λέμφωμα Hodgkin, non-Hodgkin λέμφωμα, πολλαπλούν μυέλωμα, Μυελοδυσπλαστικά και Μυελοϋπερπλαστικά σύνδρομα) και άλλα νοσήματα του αιμοποιητικού συστήματος (αναιμίες, θαλασσαιμίες, μυελικές απλασίες & διαταραχές πήξης του αίματος). Η κλινική εφημερεύει σε καθημερινή 24ωρη βάση για αιματολογικά νοσήματα, και καλύπτεται ιατρικά από 2 μέλη ΔΕΠ, 4 μόνιμους ειδικούς Αιματολόγους, 2 ειδικούς Αιματολόγους ως Επικουρικό Προσωπικό και 5 ειδικευόμενους Αιματολόγους. Νοσηλευτικά υποστηρίζεται από 24 άτομα

Είναι διασυνδεδεμένη στο European LeukemiaNet, τον EORTC  καθώς και το Ευρωπαϊκό δίκτυο BBMRI μέσω του Κέντρου Βιοτράπεζας Καρκίνου του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων, του οποίου αποτελεί συστατικό μέλος.